Chuck y Sarah descubren que la identidad de la persona que trata de acabar con Carmichael Industries es Daniel Shaw (Brandon Routh). Se escapa de la cárcel, secuestra a Sarah, y tiene como rehén en el castillo con el fin de obligar a Chuck para robar el Intersect 3.0 de la CIA. Chuck debe hacer frente a Shaw solo, sin la ayuda de la intersección.